Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700129C05RikQ9CQ77 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms