Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms