Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsmce3Q9CPR8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms