Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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