Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2a1Q99PM3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms