Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scd3Q99PL7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms