Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc4Q99PH1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms