Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms