Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gdpd3Q99LY2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms