Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Clcc1Q99LI2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Clcc1Q99LI2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clcc1Q99LI2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clcc1Q99LI2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcc1Q99LI2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Clcc1Q99LI2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clcc1Q99LI2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcc1Q99LI2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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