Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnpo2Q99LG2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms