Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms