Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q99KU6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q99KU6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q99KU6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q99KU6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q99KU6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms