Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NgrnQ99KS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms