Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf34Q99KR6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms