Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps4Q99KG7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps4Q99KG7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms