Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LsrQ99KG5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LsrQ99KG5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms