Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrabdQ99JY4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms