Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krcc1Q99JT5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms