Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms