Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csmd1Q923L3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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