Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrif1Q923B3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrif1Q923B3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms