Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms