Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms