Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zkscan3Q91VW9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zkscan3Q91VW9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zkscan3Q91VW9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms