Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hps3Q91VB4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms