Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms