Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul7Q8VE73 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms