Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep57l1Q8VDS7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms