Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8VDP2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms