Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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