Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ApobrQ8VBT6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms