Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim29Q8R2Q0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim29Q8R2Q0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms