Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc80Q8R2G6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc80Q8R2G6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms