Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms