Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms