Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms