Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ssh3Q8K330 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssh3Q8K330 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms