Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hacd3Q8K2C9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms