Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Scara5Q8K299 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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