Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd300eQ8K249 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms