Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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