Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ep400Q8CHI8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms