Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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