Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd1bQ8CFT2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd1bQ8CFT2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms