Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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