Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc9Q8CDN9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms