Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrif1Q8CDD9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms