Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrip1Q8CBD1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms