Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C1R3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms